• 社會思想史2015、臺灣社會史2015、臺灣社會研究2015、經濟社會學2015春、社會學專題研究二2015秋
• 韋伯專題2015
• 社會變遷、
• 社會學研究專題一(WORD2012)

• 社會學理論2015秋、民主政治2015春、臺灣社會研究2014春
• 政治社會學、

• 臺灣社會研究2014秋
  

• 黃樹仁，2016，〈望見流求：從福建沿海的觀測記錄論宋元名人的台灣認識〉。《成大歷史學報》50:37-84。(PDF)
• 黃樹仁，2015，〈被誇大的台灣土地改革及其漸熾的意識形態戰爭〉，《台灣社會研究季刊》 100:197-215。(PDF)

• 陳婉琪、黃樹仁，2015，〈立法院外的春吶：太陽花運動靜坐者之人口及參與圖象〉。《台灣社會學》30: 141-179。(PDF)

• 黃樹仁，2014，〈基因當然可能擴散而稀薄分佈：回應陳叔倬對〈沒有唐山媽？拓墾時期臺灣原漢通婚之研究〉的評論〉，《臺灣社會研究季刊》  96:175-183。(PDF)

• 黃樹仁，2013，〈沒有唐山媽？拓墾時期臺灣原漢通婚之研究〉，《臺灣社會研究季刊》  93:1-47。(PDF)

• 黃樹仁，2007，〈小國的學術困境：臺灣社會科學研究、教學與評量的反省〉， 《臺灣社會研究季刊》。 65:117-80。(PDF)

• 黃樹仁，2002，〈臺灣農村土地改革再省思〉，《臺灣社會研究季刊》 47:195-248 。(PDF)

• 黃樹仁，2002，〈臺灣都市化程度析疑〉，《臺灣社會學刊》27:163-205 。(PDF)
• 黃樹仁,1994,"Max Weber's The Religion of China : An Interpretation." Journal of the History of the Behavioral Sciences 30:3-18. (PDF)

• Huang, Su-Jen   1995 The Genesis of Max Weber's Sociology: The Religion of China as a Key. Ph.D. dissertation. University of   Wisconsin-Madison.
  
• 黃樹仁，2002，《心牢：農地農用意識形態與臺灣城鄉發展》。 臺北：巨流。

• Huang, Su-Jen﹐1995,“Book Review on Weber‘s Protestant Ethics: Origins,Evidence, Context , ed by Hartmut Lehmann and Guenther Roth, and Max Weber‘s Comparative Historical Sociology,by Stephen Kalberg.“ Journal of the History of the Behavioral Sciences 31: 254-8.” (PDF)
• 黃樹仁，2002，〈評張晉芬著《台灣公營事業民營化：經濟迷思的批判》〉，《臺灣社會學刊》27:217-222。(PDF)
• Huang, Su-Jen  2013  “The Predicament of Small Nation Sociology: The Case of Taiwan” Global Dialogue 3:2:21-22。（Link）

媒體投書

聯合報

• 2015-07-16／聯合報／A15版／民意論壇〈全民健保、商業保險與社會救助大規模災難的救助界線：公平〉(PDF)
• 2015-07-04／聯合報／A19版／民意論壇〈放縱偏差… 不說真話的鄉愿〉(PDF)
• 2015-04-30／聯合報／A19版／民意論壇〈市中心種菜 殺死文創〉(PDF)
• 2014-12-30／聯合報／A16版／民意論壇〈12年國教衝突 膨風的「全體民意」〉(PDF)
• 2014-10-18／聯合報／A20版／民意論壇〈請魏家捐出味全股票〉(PDF)
• 2014-05-12／聯合報／A15版／民意論壇〈人性都市 需要更多公共空間〉(PDF)
• 2013-12-24／聯合報／A17版／民意論壇〈瘋小鴨 只有娛樂沒邏輯〉(PDF)
• 2013-11-19／聯合報／A19版／民意論壇〈實質關係 更勝虛榮邦交〉(PDF)
• 2013-09-20／聯合報／A19版／民意論壇〈烤肉之外 中秋如何更有趣？〉(PDF)
• 2013-03-25／聯合報／A15版／民意論壇〈文林苑 誰的居住正義？〉(PDF)
• 2013-01-07／聯合報／A15版／民意論壇〈官員懶惰 十萬車主只好小心〉(PDF)
• 2012-05-30／聯合報／A15版／民意論壇〈謝師宴只是名目 不想再尷尬 這次老師請你們！〉(PDF)
• 2011-09-16／聯合報／A35版／民意論壇〈耀眼戰機 未必是最佳武器〉(PDF)
• 2010-09-08／聯合報／A15版／民意論壇〈停止快樂學習的幻想 不分組 學習效果一起差〉(PDF)
• 2009-11-05／聯合報／A19版／民意論壇〈新流感、美國牛 全力表演；農藥過量 老問題認命了… 公衛辯論 喜新忘舊 因小失大〉(PDF)
• 2009-07-06／聯合報／A13版／民意論壇〈尖峰對話─尼加拉瓜啟示錄 外交關節 先打通北京〉(PDF)
• 1979-10-25／聯合報／15版／ 〈新生代的反省．青年的抱負 台灣光復卅四週年紀念感言談台灣史〉(PDF)
• 1979-04-21／聯合報／02版／〈對加強中央民意機構功能的三點意見〉(PDF)

中國時報

• 2011-02-21／中國時報〈如何減少爛翻譯？〉(PDF)
• 2010-03-29／中國時報〈迷途的無殼蝸牛〉(PDF)
• 2010-03-20／中國時報〈難斥退的不適任人員〉(PDF)
• 2008-10-20／中國時報〈那天 我向學生們怒吼〉(PDF)
• 2008-09-10／中國時報〈揠苗助長，扼殺了學習〉(PDF)
• 2008-07-24／中國時報〈別人家小孩不必念大學？〉(PDF)
• 2008-05-06／中國時報〈從金錢外交迷思中醒來〉(PDF)

未出版手稿

• 推廣技職為何展不開（PDF）
• 大傷害與小恩惠（PDF）
• 奇怪的國際學生宿舍（PDF）
• 服貿爭議的擴大思考（PDF）
• 從大埔案反省臺灣農地利用（PDF）
• 請不要自稱全民（PDF）
• 高中入學方案的妥協（PDF）
• 資優班霸凌放牛班（PDF）
• 見不得私校好（PDF）
• 愛憎社會運動（PDF）
• 都市更新（PDF）
• 奶粉轉口大陸是好事（PDF）
• 打工度假或台勞（PDF）
• 被狂歡的耶誕節（PDF）
• 只醫不護的健保（PDF）
• 反剝削的兩難（PDF）
• 土地政策的理想與現實（PDF）
• 臺北的土地短缺經濟（PDF）
• 博物館的爛英文（PDF）
• 吃人的臺灣都市（PDF）
• 臺灣休閒農業的困境（PDF）
• 教育目的不在人比人（PDF）
• 低效率的學習仍然優於不學習（PDF）
• 有機農業的極限（PDF）
• 大學生太多的害處（PDF）
• 評內政部《人口政策白皮書》中的兩岸通婚政策（PDF）
• 殺不死的怪獸？評升學主義與升學制度改革（PDF）

碩士論文指導

碩士班

• 宋翔倫 (2015)：台灣進補觀念的轉變研究

• 廖均桓 (2013)：觀光業對於鄉鎮社會與經濟影響
• 鐘欣諭 (2013)：南綠北藍或階級投票
• 鮑鵬宇 (2012)：外省資本與人才對戰後台灣發展的影響
• 顏詩耕 (2011)：綠營傳統票倉？台灣南部選舉政治分析
• 陳嵩明 (2010)：清代台灣界外武力拓墾：噶瑪蘭、水沙連、與竹塹東南山區之比較研究
• 巫怡真 (2009)：地主與佃農：溪湖鎮的農村土地改革
• 謝佳佑 (2009)：台灣文化產業的憂鬱：社會變遷、發展願景、與認知動搖
• 李怡芳 (2008)：從文化分析回到經濟社會學:臺灣咖啡館擴散遲緩的歷史比較分析
• 張愛雯 (2008)：仁愛村的社會經濟變遷
• 邱盈綺 (2007)：全球化與地方產業創新：台灣南部養殖漁業的社會經濟分析
• 呂佩樺 (2007)：生活化英語教學的迷思：台北縣市兒童全英語補習班之研究
• 張佳霏 (2006)：國家代理人或地方頭人：臺北市里長的人口屬性、職務、與政治流動之初探
• 陳宇翔 (2005)：工業資本主義社會的農業變遷—台灣茶葉的社會經濟分析
• 陳柏甫 (2005)：多元迷思：大學多元入學制度之分析
• 洪人傑 (2001)：地方政府發展策略的選擇與效果：宜蘭的「反發展」模式研究

• 許達群 (2015)：原住民部落貧窮原因之探究：以福山部落為例
• 邱韋惠 (2014)：為鄉親服務:里長角色之研究
• 李秋萍 (2012)：從郊區住宅到社區營造：基隆「壯觀社區」個案研究
• 樊沛文 (2007)：基隆市素食傾向的研究